WB蛋白印跡蛋白質電泳分離的操作步驟:
1.樣本處理
蛋白質樣本首先經過離心(4 ℃,15000 r/min 離心 30 分鐘)除去不溶物,再經 SDS 上樣緩沖液 100 ℃ 變性 3~5 分鐘,使帶有強負電荷的 SDS 與帶有較弱電荷的蛋白質結合,大量 SDS 可掩蓋蛋白質自身的電荷量,只顯示 SDS 的負電荷,在 pH8.6~pH8.8 的 Tris-甘氨酸不連續 SDS-PAGE 系統中,蛋白質的泳動與自身電荷量無關,只和其分子大小有關,從而將蛋白質按分子量大小順序分離。
電泳樣品中總蛋白質濃度不能超過凝膠系統的裝載能力,可采用微型電泳系統時,每一個加樣孔內的總蛋白量不能大于 5 μg,目的蛋白量在 10 ng 左右較好,蛋白量過高將出現拖尾或蛋白帶融合現象。蛋白質樣本如經過濃縮,須用合適緩沖液透析除鹽后上樣,否則在高鹽狀態下電泳將出現電泳帶扭曲的現象。
2.凝膠選擇
根據目的蛋白質分子大小選擇合適的凝膠濃度,一般情況下,用于免疫印跡的 SDS-PAGE 凝膠濃度與所分離的蛋白質分子量間的關系如表 1 所示。為提高樣本分辨率,通常采用高一級凝膠濃度的電泳系統,將獲得更好的結果。
表 1 凝膠濃度與蛋白分子量的關系
凝膠濃度 | 分離蛋白質范圍(MW) |
8% | >50000 |
10% | 30000~200000 |
12% | 20000~150000 |
14% | 10000~100000 |
17% | 5000~100000 |
為使電泳后蛋白質從電泳凝膠中轉移至固相支持膜上,還須考慮凝膠的濃度及厚度。凝膠的百分含量和交聯度越低,轉移越容易,最軟的凝膠可產生好的轉移效率,但凝膠濃度過低可導致電泳帶變寬、融合,降低分辨率。凝膠越薄,轉移效率也就越高,但過薄的凝膠易碎,導致操作困難。多數情況下采用 0.5~1 mm 厚凝膠,為提高蛋白上樣量和檢測敏感度,可適當增加凝膠厚度,但不宜超過 2 mm。
3.蛋白質標準品選擇蛋白質凝膠電泳需要蛋白質標準品(molecular weight marker)指示系統,來顯示電泳的分離效率、轉膜效率以及樣本泳動情況。SDS-PAGE 凝膠電泳如采用普通蛋白質標準品,須經蛋白質染色后才能確認上述電泳參數,故問題發現不及時,常常導致無效的重復電泳。彩色標準品(rainbow marker)可彌補這一欠缺,如表 2 所示,該 Marker 在電泳凝膠中隨蛋白質的遷移,各分子量條帶逐漸分開,并顯示多種色彩的條帶,可直接肉眼觀察泳動及分離情況,當目的分子量大小的 Marker 遷移到合適位置(距凝膠底部 1/3 處),同時其與相鄰兩條 Marker 達到足夠分辨距離時,即可停止電泳,取出凝膠。蛋白質樣本轉膜后的轉膜效率和目的蛋白質分子量,均可通過彩色標準品直接推算。
表 2 常用高分子量彩色標準品
標準蛋白質 | 分子量 | 顏色 |
myosin | 200000 | 青 |
phosphorylase b | 97400 | 茶 |
BSA | 00069 | 紅 |
ovalbumin | 46000 | 黃 |
carbonic anhydrane | 30000 | 橙 |
trypsin inhibitor | 21500 | 綠 |
lysozyme | 14300 | 赤紫 |
4.SDS-PAGE
1)安裝電泳裝置和玻璃板。
2)配制分離膠:按照所需濃度和體積依次混合 H2O,30% 丙烯酰胺,1.5 mol/L Tris(pH8.8),10% SDS,10% 過硫酸銨,最后加入 TEMED,立即快速混勻。
3)迅速在兩玻璃板間隙灌入分離膠溶液,留出沉積膠所需體積和梳子齒長高度。小心地在膠上覆蓋一層去離子 H2O,垂直放置于室溫中,約 30 分鐘使膠凝聚。
4)倒出分離膠上方覆蓋液體,盡量吸干。
5)配制 5% 濃縮膠,依次混合 H20,30% 丙烯酰胺,1.5 mol/L Tris(pH8.8),10% SDS,10% 過硫酸銨,最后加入 TEMED,立即快速混勻。
6)在分離膠上方灌入濃縮膠,并插入梳子,避免氣泡!再灌入適量濃縮膠填滿梳子齒間縫隙,垂直放置于室溫。
7)將蛋白樣品加入等量 2X SDS 加樣緩沖液,100 ℃ 加熱 3 分鐘使蛋白變性。2000 r/min,常溫離心 3 分鐘。
8)取出濃縮膠中梳子,以 H2O 去除未聚合丙烯酰胺。將凝膠裝置固定于電泳裝置中,在上、下槽均加滿 Tris-Glysine 電泳緩沖液。
9)加樣 10~20 μl。
10)將電泳裝置通電,電壓 8V/cm,當染料前沿進入分離膠后,電壓提高到 15V/cm,電泳至溴酚藍到達膠底部,約 2~4 小時。
11)關閉電源,取出玻璃板,撬開玻璃板,小心取出凝膠。
WB蛋白印跡蛋白質電泳分離的操作步驟