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信帆生物提供:凝膠遷移(EMSA)檢測服務
服務介紹:EMSA也稱為凝膠遷移實驗或凝膠阻滯實驗,是一種用于研究蛋白質與核酸(DNA或RNA)相互作用的分子生物學技術。通過該實驗,可以檢測蛋白質是否與特定的核酸序列結合,并分析結合的特異性、親和力等。
檢測原理:
EMSA基于核酸-蛋白質復合物在電場中的遷移率與未結合核酸的蛋白質或核酸單體不同的原理。當特定的DNA或RNA片段(通常稱為探針)與待測的蛋白質樣品混合并孵育時,如果蛋白質能夠與探針結合,就會形成核酸-蛋白質復合物。這種復合物由于分子量較大,在電場中的遷移速度會比未結合的核酸或蛋白質慢。通過比較電泳后形成的條帶位置,可以判斷蛋白質是否與核酸結合,以及結合的程度。
實驗步驟:
通常將純化的蛋白和細胞粗提液和32P同位素標記的DNA或RNA探針一同保溫,在非變性的聚丙烯凝膠電泳上,分離復合物和非結合的探針。DNA-復合物或RNA-復合物比非結合的探針移動得慢。同位素標記的探針依研究的結合蛋白的不同,可是雙鏈或者是單鏈。當檢測 如轉錄調控因子一類的DNA結合蛋白,可用純化蛋白,部分純化蛋白,或核細胞抽提液。在檢測RNA結合蛋白時,依據目的RNA結合蛋白的位置,可用純化或部分純化的蛋白,也可用核或胞質細胞抽提液。競爭實驗中采用含蛋白結合序列的DNA或RNA片段和寡核苷酸片段(特異), 和其它非相關的片段(非特異),來確定DNA或RNA結合蛋白的特異性。在競爭的特異和非特異片段的存在下,依據復合物的特點和強度來確定特異結合。
注意事項:
1、探針設計:探針的長度、序列和標記方法都需要仔細考慮,以確保實驗結果的準確性和可靠性。
2、實驗條件:實驗條件(如溫度、pH值、離子強度等)對實驗結果有很大影響,需要嚴格控制。
3、結果分析:在分析結果時,需要注意區分非特異性結合和特異性結合,以及考慮可能的競爭性和抑制作用。
僅供科研實驗用,不做其他用途!